Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ddb2Q99J79 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ddb2Q99J79 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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