Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZT5

Fgd4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd4Q91ZT5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd4Q91ZT5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd4Q91ZT5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms