Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csde1Q91W50 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csde1Q91W50 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms