Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp3Q91W36 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms