Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slf1Q8R3P9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slf1Q8R3P9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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