Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms