Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc4a8Q8JZR6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms