Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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SbsnQ8CIT9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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SbsnQ8CIT9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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SbsnQ8CIT9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbsnQ8CIT9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SbsnQ8CIT9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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