Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI7

Polr2b, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2bQ8CFI7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2bQ8CFI7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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