Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms