Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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