Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc113Q8C5T8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms