Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms