Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FarsaQ8C0C7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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FarsaQ8C0C7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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FarsaQ8C0C7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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FarsaQ8C0C7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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FarsaQ8C0C7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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