Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms