Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbbp5Q8BX09 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbbp5Q8BX09 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms