Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms