Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp43Q8BUM9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp43Q8BUM9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp43Q8BUM9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp43Q8BUM9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp43Q8BUM9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp43Q8BUM9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp43Q8BUM9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp43Q8BUM9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp43Q8BUM9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp43Q8BUM9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp43Q8BUM9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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