Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco3Q8BH01 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco3Q8BH01 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms