Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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