Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-M10.6Q85ZW5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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H2-M10.6Q85ZW5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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H2-M10.6Q85ZW5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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H2-M10.6Q85ZW5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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H2-M10.6Q85ZW5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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H2-M10.6Q85ZW5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.6Q85ZW5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-M10.6Q85ZW5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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