Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc172Q810N9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms