Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme8Q715T0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms