Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC061212Q6P8K3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms