Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sp140Q6NSQ5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sp140Q6NSQ5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sp140Q6NSQ5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sp140Q6NSQ5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sp140Q6NSQ5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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