Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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