Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt39Q6IFX4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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