Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scaf8Q6DID3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms