Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sptbn2Q68FG2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sptbn2Q68FG2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms