Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms