Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms