Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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