Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms