Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms