Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AcanQ61282 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
AcanQ61282 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms