Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usf1Q61069 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usf1Q61069 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usf1Q61069 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usf1Q61069 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usf1Q61069 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usf1Q61069 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usf1Q61069 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usf1Q61069 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usf1Q61069 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usf1Q61069 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usf1Q61069 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usf1Q61069 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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