Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbbp7Q60973 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms