Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms