Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Slc6a4Q60857 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Slc6a4Q60857 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Slc6a4Q60857 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Slc6a4Q60857 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Slc6a4Q60857 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Slc6a4Q60857 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc6a4Q60857 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc6a4Q60857 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc6a4Q60857 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc6a4Q60857 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Slc6a4Q60857 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Slc6a4Q60857 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Slc6a4Q60857 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Slc6a4Q60857 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Slc6a4Q60857 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a4Q60857 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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