Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prdm1Q60636 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms