Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CttnQ60598 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms