Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim38Q5SZ99 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms