Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psme4Q5SSW2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms