Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx25Q3ZT31 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Snx25Q3ZT31 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Snx25Q3ZT31 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Snx25Q3ZT31 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Snx25Q3ZT31 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Snx25Q3ZT31 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Snx25Q3ZT31 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Snx25Q3ZT31 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Snx25Q3ZT31 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Snx25Q3ZT31 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Snx25Q3ZT31 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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