Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccdc185Q3V118 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccdc185Q3V118 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccdc185Q3V118 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccdc185Q3V118 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccdc185Q3V118 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ccdc185Q3V118 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ccdc185Q3V118 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ccdc185Q3V118 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc185Q3V118 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms