Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc33Q3ULW6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms