Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nkx6-3Q3UHX8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nkx6-3Q3UHX8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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