Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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