Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms