Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc9Q3U0M1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms